Двухэтажный объем аэровокзального комплекса получил двухчастную волнообразную кровлю, напоминающую две текущие в разном направлении реки. Металлические кассеты кровли, треугольная форма которых позволяет реализовать поверхности сложной формы, усиливают сходство с водной гладью.
Выразительный силуэт, образованный козырьками кровель, в свою очередь, служит образным отсылом к рельефному растительному орнаменту знаменитых ярославских ценинных изразцов. Переплетающиеся побеги и ветви орнамента символизируют мировое древо, объединяющее все сферы мироздания. По замыслу архитекторов, таким же пространством, объединяющим сообщение по земле, воде и небу, должен стать и новый аэропорт. Неслучайно в состав комплекса включен водный дебаркадер, призванный обеспечить связь аэровокзала с городом по Волге.